Protein–RNA interactions for Protein: Q14011

CIRBP, Cold-inducible RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIRBPQ14011 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CIRBPQ14011 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CIRBPQ14011 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CIRBPQ14011 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CIRBPQ14011 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CIRBPQ14011 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CIRBPQ14011 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CIRBPQ14011 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CIRBPQ14011 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CIRBPQ14011 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CIRBPQ14011 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CIRBPQ14011 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CIRBPQ14011 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CIRBPQ14011 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CIRBPQ14011 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CIRBPQ14011 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CIRBPQ14011 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CIRBPQ14011 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CIRBPQ14011 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CIRBPQ14011 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CIRBPQ14011 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CIRBPQ14011 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CIRBPQ14011 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIRBPQ14011 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CIRBPQ14011 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CIRBPQ14011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CIRBPQ14011 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CIRBPQ14011 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CIRBPQ14011 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CIRBPQ14011 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CIRBPQ14011 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CIRBPQ14011 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CIRBPQ14011 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CIRBPQ14011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CIRBPQ14011 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CIRBPQ14011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIRBPQ14011 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CIRBPQ14011 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIRBPQ14011 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CIRBPQ14011 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CIRBPQ14011 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CIRBPQ14011 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIRBPQ14011 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CIRBPQ14011 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIRBPQ14011 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CIRBPQ14011 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CIRBPQ14011 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CIRBPQ14011 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CIRBPQ14011 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CIRBPQ14011 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CIRBPQ14011 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CIRBPQ14011 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIRBPQ14011 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIRBPQ14011 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIRBPQ14011 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CIRBPQ14011 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CIRBPQ14011 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CIRBPQ14011 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CIRBPQ14011 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CIRBPQ14011 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CIRBPQ14011 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIRBPQ14011 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CIRBPQ14011 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CIRBPQ14011 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CIRBPQ14011 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CIRBPQ14011 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CIRBPQ14011 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CIRBPQ14011 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CIRBPQ14011 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CIRBPQ14011 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CIRBPQ14011 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CIRBPQ14011 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CIRBPQ14011 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CIRBPQ14011 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CIRBPQ14011 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIRBPQ14011 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIRBPQ14011 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CIRBPQ14011 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIRBPQ14011 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CIRBPQ14011 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CIRBPQ14011 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIRBPQ14011 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CIRBPQ14011 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CIRBPQ14011 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CIRBPQ14011 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CIRBPQ14011 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CIRBPQ14011 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CIRBPQ14011 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CIRBPQ14011 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CIRBPQ14011 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CIRBPQ14011 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIRBPQ14011 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIRBPQ14011 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CIRBPQ14011 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CIRBPQ14011 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CIRBPQ14011 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIRBPQ14011 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CIRBPQ14011 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIRBPQ14011 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CIRBPQ14011 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
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