Protein–RNA interactions for Protein: Q13563

PKD2, Polycystin-2, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2Q13563 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC37.97■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.96■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.96■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC37.95■■■■□ 3.67
PKD2Q13563 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.94■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.93■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.92■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
PKD2Q13563 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.84■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC37.84■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.83■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
PKD2Q13563 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC37.76■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC37.76■■■■□ 3.64
PKD2Q13563 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.7■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
PKD2Q13563 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.69■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.69■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC37.67■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
PKD2Q13563 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC37.63■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
PKD2Q13563 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
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