Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MTM1Q13496 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MTM1Q13496 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
MTM1Q13496 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MTM1Q13496 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
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