Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
MKRN4PQ13434 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MKRN4PQ13434 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MKRN4PQ13434 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
MKRN4PQ13434 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MKRN4PQ13434 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MKRN4PQ13434 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
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