Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CDK16Q00536 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CDK16Q00536 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CDK16Q00536 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CDK16Q00536 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CDK16Q00536 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms