Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ACTG1P63261 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ACTG1P63261 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
ACTG1P63261 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
ACTG1P63261 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms