Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RPL27P61353 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL27P61353 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL27P61353 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL27P61353 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RPL27P61353 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL27P61353 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RPL27P61353 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL27P61353 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL27P61353 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL27P61353 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RPL27P61353 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL27P61353 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPL27P61353 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL27P61353 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL27P61353 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL27P61353 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL27P61353 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL27P61353 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPL27P61353 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL27P61353 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL27P61353 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL27P61353 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL27P61353 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPL27P61353 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL27P61353 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL27P61353 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPL27P61353 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL27P61353 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL27P61353 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPL27P61353 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL27P61353 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPL27P61353 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL27P61353 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL27P61353 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL27P61353 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPL27P61353 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL27P61353 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL27P61353 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL27P61353 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL27P61353 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL27P61353 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL27P61353 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPL27P61353 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL27P61353 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL27P61353 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPL27P61353 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL27P61353 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
RPL27P61353 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPL27P61353 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL27P61353 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL27P61353 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL27P61353 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL27P61353 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL27P61353 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPL27P61353 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL27P61353 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL27P61353 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL27P61353 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL27P61353 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
RPL27P61353 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL27P61353 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL27P61353 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL27P61353 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL27P61353 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPL27P61353 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL27P61353 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL27P61353 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL27P61353 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL27P61353 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL27P61353 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL27P61353 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPL27P61353 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL27P61353 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL27P61353 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL27P61353 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL27P61353 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL27P61353 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPL27P61353 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL27P61353 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL27P61353 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPL27P61353 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL27P61353 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL27P61353 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPL27P61353 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL27P61353 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL27P61353 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL27P61353 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPL27P61353 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPL27P61353 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPL27P61353 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL27P61353 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL27P61353 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPL27P61353 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL27P61353 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL27P61353 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL27P61353 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL27P61353 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL27P61353 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL27P61353 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms