Protein–RNA interactions for Protein: P55884

EIF3B, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3BP55884 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EIF3BP55884 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EIF3BP55884 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
EIF3BP55884 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF3BP55884 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
EIF3BP55884 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms