Protein–RNA interactions for Protein: P55290

CDH13, Cadherin-13, humanhuman

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH13P55290 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH13P55290 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH13P55290 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH13P55290 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH13P55290 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH13P55290 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH13P55290 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH13P55290 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH13P55290 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH13P55290 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH13P55290 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH13P55290 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH13P55290 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH13P55290 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH13P55290 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH13P55290 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH13P55290 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH13P55290 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH13P55290 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH13P55290 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH13P55290 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH13P55290 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH13P55290 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH13P55290 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH13P55290 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH13P55290 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH13P55290 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH13P55290 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH13P55290 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH13P55290 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH13P55290 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH13P55290 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH13P55290 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH13P55290 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH13P55290 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH13P55290 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH13P55290 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH13P55290 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH13P55290 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH13P55290 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH13P55290 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH13P55290 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH13P55290 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH13P55290 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH13P55290 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH13P55290 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH13P55290 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CDH13P55290 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH13P55290 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDH13P55290 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH13P55290 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH13P55290 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDH13P55290 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH13P55290 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH13P55290 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH13P55290 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH13P55290 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH13P55290 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDH13P55290 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH13P55290 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH13P55290 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH13P55290 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDH13P55290 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH13P55290 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH13P55290 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH13P55290 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH13P55290 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDH13P55290 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH13P55290 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CDH13P55290 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CDH13P55290 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH13P55290 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
CDH13P55290 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH13P55290 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH13P55290 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH13P55290 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH13P55290 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH13P55290 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH13P55290 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CDH13P55290 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH13P55290 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH13P55290 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH13P55290 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CDH13P55290 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH13P55290 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH13P55290 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH13P55290 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH13P55290 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH13P55290 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CDH13P55290 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH13P55290 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH13P55290 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH13P55290 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH13P55290 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CDH13P55290 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CDH13P55290 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH13P55290 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH13P55290 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH13P55290 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CDH13P55290 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms