Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK3P49761 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK3P49761 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK3P49761 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CLK3P49761 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK3P49761 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK3P49761 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK3P49761 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK3P49761 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
CLK3P49761 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK3P49761 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK3P49761 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CLK3P49761 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
CLK3P49761 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK3P49761 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK3P49761 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK3P49761 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CLK3P49761 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK3P49761 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CLK3P49761 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK3P49761 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK3P49761 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK3P49761 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CLK3P49761 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK3P49761 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK3P49761 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK3P49761 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CLK3P49761 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CLK3P49761 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CLK3P49761 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK3P49761 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK3P49761 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CLK3P49761 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK3P49761 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK3P49761 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK3P49761 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK3P49761 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CLK3P49761 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLK3P49761 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CLK3P49761 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLK3P49761 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLK3P49761 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLK3P49761 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLK3P49761 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLK3P49761 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CLK3P49761 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLK3P49761 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLK3P49761 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CLK3P49761 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK3P49761 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK3P49761 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK3P49761 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK3P49761 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK3P49761 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK3P49761 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK3P49761 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CLK3P49761 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLK3P49761 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLK3P49761 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLK3P49761 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLK3P49761 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CLK3P49761 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CLK3P49761 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CLK3P49761 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLK3P49761 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLK3P49761 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLK3P49761 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CLK3P49761 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLK3P49761 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CLK3P49761 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CLK3P49761 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLK3P49761 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CLK3P49761 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.1 ms