Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CLK1P49759 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK1P49759 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK1P49759 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CLK1P49759 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK1P49759 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK1P49759 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK1P49759 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CLK1P49759 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK1P49759 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK1P49759 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CLK1P49759 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK1P49759 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK1P49759 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CLK1P49759 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CLK1P49759 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK1P49759 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK1P49759 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK1P49759 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK1P49759 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CLK1P49759 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK1P49759 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK1P49759 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLK1P49759 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK1P49759 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK1P49759 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK1P49759 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK1P49759 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK1P49759 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLK1P49759 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK1P49759 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK1P49759 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK1P49759 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK1P49759 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLK1P49759 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK1P49759 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK1P49759 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLK1P49759 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK1P49759 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK1P49759 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK1P49759 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK1P49759 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK1P49759 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK1P49759 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK1P49759 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLK1P49759 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLK1P49759 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLK1P49759 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK1P49759 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK1P49759 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK1P49759 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLK1P49759 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK1P49759 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK1P49759 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLK1P49759 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK1P49759 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK1P49759 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLK1P49759 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK1P49759 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK1P49759 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK1P49759 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLK1P49759 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK1P49759 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLK1P49759 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK1P49759 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK1P49759 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK1P49759 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK1P49759 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK1P49759 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLK1P49759 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK1P49759 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK1P49759 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK1P49759 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK1P49759 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CLK1P49759 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK1P49759 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CLK1P49759 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK1P49759 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK1P49759 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CLK1P49759 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK1P49759 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK1P49759 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK1P49759 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CLK1P49759 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK1P49759 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK1P49759 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK1P49759 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK1P49759 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK1P49759 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CLK1P49759 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK1P49759 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK1P49759 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK1P49759 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK1P49759 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CLK1P49759 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CLK1P49759 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK1P49759 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK1P49759 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CLK1P49759 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CLK1P49759 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms