Protein–RNA interactions for Protein: P48547

KCNC1, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 1, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC1P48547 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.59
KCNC1P48547 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCNC1P48547 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCNC1P48547 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCNC1P48547 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCNC1P48547 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms