Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
SLC6A9P48067 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SLC6A9P48067 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SLC6A9P48067 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC6A9P48067 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms