Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSR1P43307 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSR1P43307 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSR1P43307 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SSR1P43307 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SSR1P43307 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SSR1P43307 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSR1P43307 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSR1P43307 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SSR1P43307 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSR1P43307 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
SSR1P43307 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSR1P43307 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SSR1P43307 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSR1P43307 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSR1P43307 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSR1P43307 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SSR1P43307 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SSR1P43307 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSR1P43307 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSR1P43307 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSR1P43307 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSR1P43307 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSR1P43307 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SSR1P43307 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSR1P43307 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
SSR1P43307 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SSR1P43307 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SSR1P43307 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
SSR1P43307 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSR1P43307 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSR1P43307 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SSR1P43307 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
SSR1P43307 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSR1P43307 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSR1P43307 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SSR1P43307 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSR1P43307 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SSR1P43307 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SSR1P43307 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSR1P43307 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSR1P43307 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSR1P43307 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSR1P43307 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSR1P43307 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSR1P43307 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSR1P43307 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SSR1P43307 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSR1P43307 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
SSR1P43307 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSR1P43307 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SSR1P43307 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSR1P43307 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SSR1P43307 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSR1P43307 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSR1P43307 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSR1P43307 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSR1P43307 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSR1P43307 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SSR1P43307 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSR1P43307 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSR1P43307 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SSR1P43307 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSR1P43307 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSR1P43307 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSR1P43307 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSR1P43307 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSR1P43307 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SSR1P43307 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
SSR1P43307 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSR1P43307 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSR1P43307 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SSR1P43307 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SSR1P43307 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSR1P43307 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSR1P43307 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSR1P43307 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSR1P43307 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSR1P43307 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
SSR1P43307 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSR1P43307 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSR1P43307 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SSR1P43307 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSR1P43307 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSR1P43307 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SSR1P43307 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SSR1P43307 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSR1P43307 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SSR1P43307 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSR1P43307 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SSR1P43307 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSR1P43307 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SSR1P43307 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SSR1P43307 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSR1P43307 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SSR1P43307 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSR1P43307 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSR1P43307 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSR1P43307 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SSR1P43307 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms