Protein–RNA interactions for Protein: P43004

SLC1A2, Excitatory amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A2P43004 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A2P43004 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A2P43004 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A2P43004 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SLC1A2P43004 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SLC1A2P43004 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A2P43004 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SLC1A2P43004 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SLC1A2P43004 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC1A2P43004 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC1A2P43004 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC1A2P43004 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC1A2P43004 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.3 ms