Protein–RNA interactions for Protein: P42771

CDKN2A, Cyclin-dependent kinase inhibitor 2A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN2AP42771 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CDKN2AP42771 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CDKN2AP42771 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
CDKN2AP42771 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CDKN2AP42771 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDKN2AP42771 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms