Protein–RNA interactions for Protein: P39023

RPL3, 60S ribosomal protein L3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL3P39023 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL3P39023 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPL3P39023 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
RPL3P39023 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL3P39023 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL3P39023 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL3P39023 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPL3P39023 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3P39023 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3P39023 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
RPL3P39023 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL3P39023 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPL3P39023 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL3P39023 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL3P39023 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL3P39023 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPL3P39023 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL3P39023 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL3P39023 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPL3P39023 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL3P39023 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL3P39023 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL3P39023 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RPL3P39023 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL3P39023 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL3P39023 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RPL3P39023 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL3P39023 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL3P39023 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL3P39023 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL3P39023 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RPL3P39023 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RPL3P39023 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL3P39023 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL3P39023 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL3P39023 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL3P39023 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RPL3P39023 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL3P39023 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL3P39023 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL3P39023 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL3P39023 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RPL3P39023 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RPL3P39023 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL3P39023 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL3P39023 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL3P39023 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RPL3P39023 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPL3P39023 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPL3P39023 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RPL3P39023 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL3P39023 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL3P39023 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL3P39023 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RPL3P39023 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3P39023 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3P39023 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3P39023 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3P39023 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3P39023 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3P39023 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RPL3P39023 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3P39023 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3P39023 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3P39023 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3P39023 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3P39023 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RPL3P39023 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL3P39023 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RPL3P39023 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL3P39023 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL3P39023 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL3P39023 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL3P39023 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL3P39023 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL3P39023 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RPL3P39023 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL3P39023 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL3P39023 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
RPL3P39023 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3P39023 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3P39023 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3P39023 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3P39023 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3P39023 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
RPL3P39023 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3P39023 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3P39023 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3P39023 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3P39023 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3P39023 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
RPL3P39023 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL3P39023 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RPL3P39023 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3P39023 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3P39023 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3P39023 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3P39023 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3P39023 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RPL3P39023 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms