Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC1P35052 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GPC1P35052 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC1P35052 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC1P35052 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC1P35052 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC1P35052 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GPC1P35052 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC1P35052 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC1P35052 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC1P35052 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC1P35052 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
GPC1P35052 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC1P35052 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC1P35052 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC1P35052 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC1P35052 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
GPC1P35052 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC1P35052 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC1P35052 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC1P35052 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
GPC1P35052 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC1P35052 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC1P35052 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC1P35052 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC1P35052 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
GPC1P35052 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC1P35052 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC1P35052 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC1P35052 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
GPC1P35052 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC1P35052 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
GPC1P35052 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC1P35052 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
GPC1P35052 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC1P35052 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC1P35052 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
GPC1P35052 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC1P35052 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC1P35052 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
GPC1P35052 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC1P35052 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC1P35052 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC1P35052 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC1P35052 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC1P35052 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC1P35052 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC1P35052 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC1P35052 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC1P35052 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC1P35052 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC1P35052 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC1P35052 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC1P35052 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC1P35052 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC1P35052 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC1P35052 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC1P35052 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC1P35052 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC1P35052 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC1P35052 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC1P35052 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC1P35052 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC1P35052 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC1P35052 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC1P35052 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC1P35052 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC1P35052 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC1P35052 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC1P35052 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC1P35052 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC1P35052 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC1P35052 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC1P35052 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC1P35052 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC1P35052 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC1P35052 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC1P35052 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC1P35052 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC1P35052 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC1P35052 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC1P35052 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC1P35052 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC1P35052 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC1P35052 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC1P35052 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC1P35052 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC1P35052 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC1P35052 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC1P35052 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC1P35052 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC1P35052 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC1P35052 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC1P35052 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC1P35052 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC1P35052 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC1P35052 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC1P35052 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC1P35052 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC1P35052 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms