Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP24386 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP24386 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CHMP24386 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP24386 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP24386 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP24386 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP24386 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP24386 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CHMP24386 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CHMP24386 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CHMP24386 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP24386 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP24386 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CHMP24386 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP24386 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP24386 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP24386 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP24386 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP24386 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP24386 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP24386 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CHMP24386 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP24386 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP24386 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP24386 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CHMP24386 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP24386 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP24386 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP24386 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP24386 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP24386 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CHMP24386 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP24386 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP24386 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CHMP24386 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP24386 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP24386 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP24386 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CHMP24386 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CHMP24386 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP24386 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP24386 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP24386 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP24386 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP24386 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CHMP24386 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP24386 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP24386 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP24386 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP24386 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP24386 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP24386 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CHMP24386 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP24386 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP24386 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP24386 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP24386 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHMP24386 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP24386 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP24386 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP24386 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP24386 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP24386 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHMP24386 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP24386 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP24386 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP24386 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP24386 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP24386 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP24386 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHMP24386 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHMP24386 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP24386 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP24386 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP24386 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHMP24386 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP24386 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CHMP24386 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP24386 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP24386 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP24386 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP24386 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHMP24386 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP24386 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CHMP24386 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP24386 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP24386 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP24386 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP24386 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP24386 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP24386 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP24386 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CHMP24386 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP24386 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP24386 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP24386 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP24386 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CHMP24386 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CHMP24386 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms