Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYF6P23409 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYF6P23409 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYF6P23409 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYF6P23409 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYF6P23409 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MYF6P23409 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYF6P23409 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MYF6P23409 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYF6P23409 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYF6P23409 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYF6P23409 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYF6P23409 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MYF6P23409 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYF6P23409 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYF6P23409 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYF6P23409 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MYF6P23409 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYF6P23409 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MYF6P23409 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MYF6P23409 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYF6P23409 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYF6P23409 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYF6P23409 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYF6P23409 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYF6P23409 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYF6P23409 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MYF6P23409 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYF6P23409 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYF6P23409 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MYF6P23409 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYF6P23409 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MYF6P23409 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYF6P23409 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYF6P23409 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MYF6P23409 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYF6P23409 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYF6P23409 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MYF6P23409 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYF6P23409 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MYF6P23409 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYF6P23409 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYF6P23409 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYF6P23409 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MYF6P23409 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYF6P23409 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYF6P23409 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYF6P23409 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYF6P23409 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MYF6P23409 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYF6P23409 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
MYF6P23409 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF6P23409 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF6P23409 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF6P23409 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
MYF6P23409 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
MYF6P23409 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF6P23409 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF6P23409 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF6P23409 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF6P23409 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
MYF6P23409 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF6P23409 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF6P23409 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF6P23409 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
MYF6P23409 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF6P23409 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF6P23409 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF6P23409 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF6P23409 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
MYF6P23409 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
MYF6P23409 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF6P23409 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF6P23409 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF6P23409 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF6P23409 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF6P23409 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF6P23409 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
MYF6P23409 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYF6P23409 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYF6P23409 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYF6P23409 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
MYF6P23409 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
MYF6P23409 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF6P23409 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF6P23409 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF6P23409 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF6P23409 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF6P23409 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
MYF6P23409 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
MYF6P23409 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
MYF6P23409 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF6P23409 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF6P23409 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF6P23409 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF6P23409 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF6P23409 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF6P23409 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
MYF6P23409 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
MYF6P23409 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.9 ms