Protein–RNA interactions for Protein: P13804

ETFA, Electron transfer flavoprotein subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFAP13804 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFAP13804 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ETFAP13804 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFAP13804 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFAP13804 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFAP13804 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ETFAP13804 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFAP13804 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFAP13804 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ETFAP13804 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFAP13804 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFAP13804 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFAP13804 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFAP13804 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFAP13804 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFAP13804 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ETFAP13804 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFAP13804 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFAP13804 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ETFAP13804 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFAP13804 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFAP13804 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFAP13804 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ETFAP13804 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFAP13804 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFAP13804 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFAP13804 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ETFAP13804 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFAP13804 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ETFAP13804 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFAP13804 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFAP13804 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFAP13804 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFAP13804 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ETFAP13804 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ETFAP13804 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFAP13804 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFAP13804 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ETFAP13804 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ETFAP13804 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETFAP13804 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ETFAP13804 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETFAP13804 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ETFAP13804 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFAP13804 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFAP13804 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFAP13804 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFAP13804 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFAP13804 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ETFAP13804 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFAP13804 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFAP13804 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFAP13804 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFAP13804 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFAP13804 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ETFAP13804 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETFAP13804 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ETFAP13804 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFAP13804 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFAP13804 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFAP13804 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFAP13804 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ETFAP13804 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFAP13804 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFAP13804 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ETFAP13804 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETFAP13804 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ETFAP13804 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ETFAP13804 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ETFAP13804 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
ETFAP13804 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ETFAP13804 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ETFAP13804 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETFAP13804 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETFAP13804 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETFAP13804 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETFAP13804 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETFAP13804 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETFAP13804 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETFAP13804 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETFAP13804 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETFAP13804 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETFAP13804 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETFAP13804 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETFAP13804 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFAP13804 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFAP13804 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFAP13804 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFAP13804 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFAP13804 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETFAP13804 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ETFAP13804 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms