Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRG2P13727 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PRG2P13727 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG2P13727 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG2P13727 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRG2P13727 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG2P13727 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG2P13727 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG2P13727 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRG2P13727 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRG2P13727 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG2P13727 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
PRG2P13727 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG2P13727 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG2P13727 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG2P13727 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG2P13727 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG2P13727 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG2P13727 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG2P13727 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PRG2P13727 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG2P13727 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG2P13727 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG2P13727 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG2P13727 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG2P13727 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG2P13727 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRG2P13727 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG2P13727 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG2P13727 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG2P13727 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRG2P13727 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG2P13727 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRG2P13727 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG2P13727 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG2P13727 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG2P13727 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRG2P13727 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG2P13727 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG2P13727 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG2P13727 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRG2P13727 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG2P13727 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG2P13727 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRG2P13727 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG2P13727 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG2P13727 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG2P13727 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRG2P13727 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG2P13727 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PRG2P13727 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG2P13727 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG2P13727 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG2P13727 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG2P13727 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PRG2P13727 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG2P13727 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG2P13727 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PRG2P13727 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG2P13727 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG2P13727 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG2P13727 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG2P13727 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG2P13727 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG2P13727 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PRG2P13727 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG2P13727 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG2P13727 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG2P13727 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG2P13727 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG2P13727 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PRG2P13727 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PRG2P13727 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG2P13727 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG2P13727 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PRG2P13727 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG2P13727 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG2P13727 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG2P13727 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PRG2P13727 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms