Protein–RNA interactions for Protein: P11233

RALA, Ras-related protein Ral-A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALAP11233 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RALAP11233 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RALAP11233 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
RALAP11233 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
RALAP11233 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RALAP11233 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
RALAP11233 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
RALAP11233 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
RALAP11233 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RALAP11233 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
RALAP11233 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RALAP11233 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RALAP11233 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RALAP11233 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RALAP11233 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RALAP11233 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RALAP11233 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
RALAP11233 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RALAP11233 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RALAP11233 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RALAP11233 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RALAP11233 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RALAP11233 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RALAP11233 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RALAP11233 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RALAP11233 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RALAP11233 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RALAP11233 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RALAP11233 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RALAP11233 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RALAP11233 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RALAP11233 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RALAP11233 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RALAP11233 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RALAP11233 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RALAP11233 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RALAP11233 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RALAP11233 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RALAP11233 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RALAP11233 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RALAP11233 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RALAP11233 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RALAP11233 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RALAP11233 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RALAP11233 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RALAP11233 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RALAP11233 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RALAP11233 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RALAP11233 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RALAP11233 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RALAP11233 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RALAP11233 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
RALAP11233 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RALAP11233 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RALAP11233 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RALAP11233 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RALAP11233 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RALAP11233 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RALAP11233 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
RALAP11233 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RALAP11233 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RALAP11233 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RALAP11233 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RALAP11233 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RALAP11233 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RALAP11233 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RALAP11233 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RALAP11233 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RALAP11233 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RALAP11233 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RALAP11233 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RALAP11233 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RALAP11233 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALAP11233 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALAP11233 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALAP11233 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALAP11233 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALAP11233 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RALAP11233 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
RALAP11233 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RALAP11233 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RALAP11233 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RALAP11233 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RALAP11233 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RALAP11233 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RALAP11233 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RALAP11233 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RALAP11233 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RALAP11233 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms