Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SAA1P0DJI8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SAA1P0DJI8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SAA1P0DJI8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SAA1P0DJI8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms