Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HMGN2P05204 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HMGN2P05204 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HMGN2P05204 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HMGN2P05204 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HMGN2P05204 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms