Protein–RNA interactions for Protein: P05204

HMGN2, Non-histone chromosomal protein HMG-17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 90 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN2P05204 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.59■■■□□ 2.65
HMGN2P05204 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
HMGN2P05204 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31■■■□□ 2.55
HMGN2P05204 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HMGN2P05204 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
HMGN2P05204 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
HMGN2P05204 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
HMGN2P05204 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
HMGN2P05204 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HMGN2P05204 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
HMGN2P05204 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
HMGN2P05204 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
HMGN2P05204 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
HMGN2P05204 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
HMGN2P05204 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
HMGN2P05204 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HMGN2P05204 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HMGN2P05204 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HMGN2P05204 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HMGN2P05204 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
HMGN2P05204 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGN2P05204 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HMGN2P05204 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HMGN2P05204 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
HMGN2P05204 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
HMGN2P05204 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
HMGN2P05204 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
HMGN2P05204 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
HMGN2P05204 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGN2P05204 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
HMGN2P05204 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
HMGN2P05204 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
HMGN2P05204 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
HMGN2P05204 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
HMGN2P05204 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
HMGN2P05204 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGN2P05204 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
HMGN2P05204 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
HMGN2P05204 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
HMGN2P05204 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HMGN2P05204 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HMGN2P05204 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HMGN2P05204 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
HMGN2P05204 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HMGN2P05204 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HMGN2P05204 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HMGN2P05204 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HMGN2P05204 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGN2P05204 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HMGN2P05204 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HMGN2P05204 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGN2P05204 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HMGN2P05204 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
HMGN2P05204 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
HMGN2P05204 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGN2P05204 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
HMGN2P05204 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
HMGN2P05204 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HMGN2P05204 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
HMGN2P05204 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HMGN2P05204 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
HMGN2P05204 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
HMGN2P05204 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGN2P05204 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
HMGN2P05204 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
HMGN2P05204 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
HMGN2P05204 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGN2P05204 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HMGN2P05204 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HMGN2P05204 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HMGN2P05204 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HMGN2P05204 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HMGN2P05204 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HMGN2P05204 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HMGN2P05204 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
HMGN2P05204 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HMGN2P05204 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
HMGN2P05204 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
HMGN2P05204 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
HMGN2P05204 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
HMGN2P05204 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGN2P05204 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
HMGN2P05204 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HMGN2P05204 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HMGN2P05204 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGN2P05204 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HMGN2P05204 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HMGN2P05204 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HMGN2P05204 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HMGN2P05204 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HMGN2P05204 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGN2P05204 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HMGN2P05204 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HMGN2P05204 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
HMGN2P05204 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HMGN2P05204 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HMGN2P05204 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HMGN2P05204 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGN2P05204 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HMGN2P05204 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 921.7 ms