Protein–RNA interactions for Protein: P05160

F13B, Coagulation factor XIII B chain, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F13BP05160 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
F13BP05160 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F13BP05160 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
F13BP05160 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F13BP05160 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
F13BP05160 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
F13BP05160 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13BP05160 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13BP05160 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13BP05160 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13BP05160 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
F13BP05160 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
F13BP05160 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13BP05160 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
F13BP05160 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F13BP05160 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F13BP05160 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F13BP05160 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
F13BP05160 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F13BP05160 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F13BP05160 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F13BP05160 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
F13BP05160 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F13BP05160 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
F13BP05160 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13BP05160 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13BP05160 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13BP05160 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
F13BP05160 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13BP05160 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13BP05160 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
F13BP05160 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
F13BP05160 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13BP05160 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
F13BP05160 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13BP05160 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13BP05160 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13BP05160 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
F13BP05160 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13BP05160 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13BP05160 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
F13BP05160 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13BP05160 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13BP05160 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13BP05160 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13BP05160 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13BP05160 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
F13BP05160 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13BP05160 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13BP05160 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
F13BP05160 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13BP05160 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
F13BP05160 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13BP05160 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
F13BP05160 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13BP05160 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
F13BP05160 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13BP05160 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13BP05160 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
F13BP05160 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
F13BP05160 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13BP05160 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13BP05160 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13BP05160 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13BP05160 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
F13BP05160 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
F13BP05160 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F13BP05160 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F13BP05160 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
F13BP05160 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F13BP05160 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
F13BP05160 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13BP05160 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13BP05160 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13BP05160 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13BP05160 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13BP05160 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13BP05160 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13BP05160 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
F13BP05160 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
F13BP05160 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F13BP05160 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F13BP05160 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
F13BP05160 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F13BP05160 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
F13BP05160 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F13BP05160 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
F13BP05160 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F13BP05160 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
F13BP05160 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F13BP05160 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
F13BP05160 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms