Protein–RNA interactions for Protein: O94806

PRKD3, Serine/threonine-protein kinase D3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD3O94806 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRKD3O94806 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PRKD3O94806 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
PRKD3O94806 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
PRKD3O94806 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms