Protein–RNA interactions for Protein: O60930

RNASEH1, Ribonuclease H1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNASEH1O60930 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
RNASEH1O60930 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RNASEH1O60930 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RNASEH1O60930 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RNASEH1O60930 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms