Protein–RNA interactions for Protein: O43791

SPOP, Speckle-type POZ protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOPO43791 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SPOPO43791 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOPO43791 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOPO43791 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOPO43791 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOPO43791 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOPO43791 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOPO43791 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SPOPO43791 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOPO43791 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOPO43791 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOPO43791 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOPO43791 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SPOPO43791 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPOPO43791 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SPOPO43791 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOPO43791 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOPO43791 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SPOPO43791 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SPOPO43791 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPOPO43791 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPOPO43791 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPOPO43791 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SPOPO43791 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPOPO43791 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPOPO43791 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPOPO43791 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SPOPO43791 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SPOPO43791 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPOPO43791 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPOPO43791 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPOPO43791 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SPOPO43791 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SPOPO43791 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPOPO43791 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPOPO43791 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPOPO43791 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
SPOPO43791 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
SPOPO43791 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPOPO43791 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPOPO43791 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
SPOPO43791 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPOPO43791 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SPOPO43791 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPOPO43791 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPOPO43791 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
SPOPO43791 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
SPOPO43791 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SPOPO43791 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPOPO43791 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPOPO43791 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SPOPO43791 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPOPO43791 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPOPO43791 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPOPO43791 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPOPO43791 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPOPO43791 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SPOPO43791 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
SPOPO43791 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPOPO43791 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
SPOPO43791 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPOPO43791 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
SPOPO43791 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SPOPO43791 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPOPO43791 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPOPO43791 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPOPO43791 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SPOPO43791 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPOPO43791 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPOPO43791 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPOPO43791 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
SPOPO43791 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPOPO43791 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
SPOPO43791 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPOPO43791 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SPOPO43791 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPOPO43791 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPOPO43791 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPOPO43791 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPOPO43791 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPOPO43791 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPOPO43791 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPOPO43791 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SPOPO43791 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPOPO43791 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPOPO43791 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPOPO43791 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPOPO43791 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPOPO43791 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SPOPO43791 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPOPO43791 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SPOPO43791 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms