Protein–RNA interactions for Protein: O43520

ATP8B1, Phospholipid-transporting ATPase IC, humanhuman

Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8B1O43520 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8B1O43520 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8B1O43520 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP8B1O43520 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP8B1O43520 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ATP8B1O43520 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ATP8B1O43520 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms