Protein–RNA interactions for Protein: O43251

RBFOX2, RNA binding protein fox-1 homolog 2, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBFOX2O43251 SORBS1-206ENST00000371228 558 ntTSL 56.85□□□□□ -1.312e-10■■■■■ 48.4
RBFOX2O43251 B3GAT3-206ENST00000534715 868 ntTSL 517.81■□□□□ 0.441e-9■■■■■ 48.4
RBFOX2O43251 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.051e-9■■■■■ 48.4
RBFOX2O43251 SH3BP2-229ENST00000515802 2247 ntTSL 212.39□□□□□ -0.436e-7■■■■■ 48.4
RBFOX2O43251 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.28e-12■■■■■ 48.2
RBFOX2O43251 MMP25-AS1-208ENST00000573953 1001 ntTSL 315.86■□□□□ 0.138e-12■■■■■ 48.2
RBFOX2O43251 NDRG1-205ENST00000517745 391 ntTSL 310.72□□□□□ -0.695e-11■■■■■ 48
RBFOX2O43251 NDRG1-219ENST00000521544 709 ntTSL 59.57□□□□□ -0.885e-11■■■■■ 48
RBFOX2O43251 NDRG1-224ENST00000522738 530 ntTSL 58.37□□□□□ -1.075e-11■■■■■ 48
RBFOX2O43251 NDRG1-215ENST00000520943 536 ntTSL 47.53□□□□□ -1.25e-11■■■■■ 48
RBFOX2O43251 NDRG1-208ENST00000518094 347 ntTSL 26.06□□□□□ -1.445e-11■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-210ENST00000541448 567 ntTSL 316.49■□□□□ 0.232e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 RFLNA-203ENST00000389727 2385 ntAPPRIS P2 TSL 516.34■□□□□ 0.212e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-214ENST00000546098 474 ntTSL 414.84□□□□□ -0.032e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-211ENST00000542493 591 ntTSL 414.17□□□□□ -0.142e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.452e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.462e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.612e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-203ENST00000537532 592 ntTSL 410.45□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-205ENST00000539257 271 ntTSL 510.42□□□□□ -0.742e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-213ENST00000543017 455 ntTSL 510.09□□□□□ -0.792e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 RFLNA-204ENST00000545615 449 ntTSL 39.59□□□□□ -0.872e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 ZNF664-201ENST00000337815 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.912e-10■■■■■ 48
RBFOX2O43251 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.417e-14■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 A2M-203ENST00000462568 546 ntTSL 22.95□□□□□ -1.947e-14■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 MGAT5-201ENST00000281923 8144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.152e-11■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 MGAT5-202ENST00000409645 8252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.272e-11■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.411e-7■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 CDK5RAP2-212ENST00000480112 5826 ntTSL 1 (best)11.05□□□□□ -0.641e-7■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 CDK5RAP2-201ENST00000349780 6228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.781e-7■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 CDK5RAP2-203ENST00000360822 5551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.36□□□□□ -1.071e-7■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 CDK5RAP2-216ENST00000483412 6235 ntTSL 1 (best)8.21□□□□□ -1.091e-7■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 CDK5RAP2-205ENST00000425647 2747 ntTSL 28.18□□□□□ -1.11e-7■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 CDK5RAP2-209ENST00000473282 5956 ntTSL 1 (best)7.4□□□□□ -1.221e-7■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 CDK5RAP2-204ENST00000416449 3902 ntTSL 56.91□□□□□ -1.31e-7■■■■■ 47.9
RBFOX2O43251 DOCK6-201ENST00000294618 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.783e-7■■■■■ 47.7
RBFOX2O43251 DOCK6-207ENST00000587656 4009 ntTSL 59.5□□□□□ -0.893e-7■■■■■ 47.7
RBFOX2O43251 CPE-205ENST00000513982 564 ntTSL 46.36□□□□□ -1.392e-13■■■■■ 47.7
RBFOX2O43251 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.612e-7■■■■■ 47.6
RBFOX2O43251 SH3PXD2A-202ENST00000355946 11245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.45□□□□□ -1.222e-7■■■■■ 47.6
RBFOX2O43251 ARFGAP1-215ENST00000522403 995 ntTSL 512.55□□□□□ -0.44e-21■■■■■ 47.5
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RBFOX2O43251 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.399e-9■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 ARHGEF28-210ENST00000510312 8285 ntTSL 27.63□□□□□ -1.199e-9■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-215ENST00000570125 681 ntTSL 421.92■■□□□ 1.19e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.019e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.179e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.49e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.429e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.519e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.71□□□□□ -0.549e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-218ENST00000614449 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.69e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-202ENST00000396593 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.649e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-212ENST00000568968 461 ntTSL 210.76□□□□□ -0.699e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.79e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-211ENST00000568117 521 ntTSL 310.63□□□□□ -0.719e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-210ENST00000567908 565 ntTSL 210.53□□□□□ -0.729e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 CARHSP1-207ENST00000565287 556 ntTSL 310.45□□□□□ -0.749e-10■■■■■ 47.3
RBFOX2O43251 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.486e-12■■■■■ 47.1
RBFOX2O43251 HSPG2-203ENST00000374695 14327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.226e-10■■■■■ 47.1
RBFOX2O43251 UTRN-206ENST00000421035 572 ntTSL 25.09□□□□□ -1.591e-13■■■■■ 47
RBFOX2O43251 AP3D1-203ENST00000585652 4433 ntTSL 210.81□□□□□ -0.685e-10■■■■■ 47
RBFOX2O43251 AP3D1-206ENST00000589223 3357 ntTSL 29.82□□□□□ -0.845e-10■■■■■ 47
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RBFOX2O43251 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.112e-9■■■■■ 46.9
RBFOX2O43251 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.22e-9■■■■■ 46.9
RBFOX2O43251 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.552e-9■■■■■ 46.9
RBFOX2O43251 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.42□□□□□ -0.13e-7■■■■■ 46.9
RBFOX2O43251 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-7■■■■■ 46.9
RBFOX2O43251 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.693e-7■■■■■ 46.9
RBFOX2O43251 ARFGAP1-214ENST00000520485 1548 ntTSL 218.35■□□□□ 0.534e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.124e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.224e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.274e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.394e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.464e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.484e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-221ENST00000549047 1040 ntTSL 511.6□□□□□ -0.554e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-218ENST00000523460 572 ntTSL 410.77□□□□□ -0.694e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 ARFGAP1-206ENST00000518601 905 ntTSL 510.54□□□□□ -0.724e-21■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 RBM10-201ENST00000329236 3201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.622e-8■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 RBM10-202ENST00000345781 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.642e-8■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.662e-8■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 RBM10-203ENST00000377604 3747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-8■■■■■ 46.8
RBFOX2O43251 SCAI-205ENST00000477186 1808 ntTSL 215.15■□□□□ 0.023e-13■■■■■ 46.7
RBFOX2O43251 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.263e-13■■■■■ 46.7
RBFOX2O43251 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.813e-13■■■■■ 46.7
RBFOX2O43251 POLD1-211ENST00000600746 999 ntTSL 513.68□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 46.7
RBFOX2O43251 POLD1-203ENST00000593887 695 ntTSL 512.92□□□□□ -0.341e-7■■■■■ 46.7
RBFOX2O43251 POLD1-213ENST00000601098 783 ntTSL 312.28□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 46.7
RBFOX2O43251 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-7■■■■■ 46.5
RBFOX2O43251 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.044e-7■■■■■ 46.5
RBFOX2O43251 IL6R-207ENST00000515190 570 ntTSL 213.47□□□□□ -0.254e-7■■■■■ 46.5
RBFOX2O43251 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.424e-7■■■■■ 46.5
RBFOX2O43251 IL6R-203ENST00000476006 881 ntTSL 310.5□□□□□ -0.734e-7■■■■■ 46.5
RBFOX2O43251 WDR90-214ENST00000549024 2257 ntTSL 215.33■□□□□ 0.054e-7■■■■■ 46.4
RBFOX2O43251 WDR90-223ENST00000552728 3133 ntTSL 512.66□□□□□ -0.384e-7■■■■■ 46.4
RBFOX2O43251 FGFR3-207ENST00000474521 545 ntTSL 213.82□□□□□ -0.25e-20■■■■■ 46.2
RBFOX2O43251 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.222e-13■■■■■ 46.1
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