RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541448.5

ZNF664-210, Transcript of zinc finger protein 664, humanhuman

TSL 3

Gene ZNF664, Length 567 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF664-210ENST00000541448 NISCHQ9Y2I1 1504 aa53.97■■■■■ 6.23
ZNF664-210ENST00000541448 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa48.41■■■■■ 5.34
ZNF664-210ENST00000541448 ABCC9O60706 1549 aa47.94■■■■■ 5.26
ZNF664-210ENST00000541448 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa45.89■■■■■ 4.94
ZNF664-210ENST00000541448 NACADO15069 1562 aa45.67■■■■■ 4.9
ZNF664-210ENST00000541448 DCAF8L2P0C7V8 631 aa45.34■■■■■ 4.85
ZNF664-210ENST00000541448 MYO15BQ96JP2 1530 aa45.16■■■■■ 4.82
ZNF664-210ENST00000541448 UNC13AQ9UPW8 1703 aa44.89■■■■■ 4.78
ZNF664-210ENST00000541448 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP44.78■■■■■ 4.76
ZNF664-210ENST00000541448 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa44.67■■■■■ 4.74
ZNF664-210ENST00000541448 DNAJC5BQ9UF47 199 aa44.65■■■■■ 4.74
ZNF664-210ENST00000541448 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP44.64■■■■■ 4.74
ZNF664-210ENST00000541448 BICRAQ9NZM4 1560 aa44.48■■■■■ 4.71
ZNF664-210ENST00000541448 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa44.03■■■■■ 4.64
ZNF664-210ENST00000541448 SCRIBQ14160 1630 aa43.99■■■■■ 4.63
ZNF664-210ENST00000541448 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa43.4■■■■■ 4.54
ZNF664-210ENST00000541448 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP43.38■■■■■ 4.54
ZNF664-210ENST00000541448 CECR2Q9BXF3 1484 aa43.2■■■■■ 4.51
ZNF664-210ENST00000541448 NCAPD3P42695 1498 aa42.11■■■■■ 4.33
ZNF664-210ENST00000541448 SMARCA4P51532 1647 aa42.06■■■■■ 4.32
ZNF664-210ENST00000541448 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa41.98■■■■■ 4.31
ZNF664-210ENST00000541448 SMARCA2P51531 1590 aa41.97■■■■■ 4.31
ZNF664-210ENST00000541448 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP41.92■■■■■ 4.3
ZNF664-210ENST00000541448 HMGXB3Q12766 1538 aa41.85■■■■■ 4.29
ZNF664-210ENST00000541448 PEG3Q9GZU2 1588 aa41.68■■■■■ 4.26
ZNF664-210ENST00000541448 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP41.61■■■■■ 4.25
ZNF664-210ENST00000541448 MROH2BQ7Z745 1585 aa41.54■■■■■ 4.24
ZNF664-210ENST00000541448 ERCC6Q03468 1493 aa41.44■■■■■ 4.22
ZNF664-210ENST00000541448 CUX2O14529 1486 aa41.31■■■■■ 4.2
ZNF664-210ENST00000541448 NESP48681 1621 aa41.26■■■■■ 4.19
ZNF664-210ENST00000541448 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa41.16■■■■■ 4.18
ZNF664-210ENST00000541448 WIZO95785 1651 aa41.09■■■■■ 4.17
ZNF664-210ENST00000541448 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.9■■■■■ 4.14
ZNF664-210ENST00000541448 PDS5BQ9NTI5 1447 aa40.89■■■■■ 4.14
ZNF664-210ENST00000541448 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP40.86■■■■■ 4.13
ZNF664-210ENST00000541448 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa40.84■■■■■ 4.13
ZNF664-210ENST00000541448 CADPSQ9ULU8 1353 aa40.83■■■■■ 4.13
ZNF664-210ENST00000541448 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP40.79■■■■■ 4.12
ZNF664-210ENST00000541448 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP40.62■■■■■ 4.09
ZNF664-210ENST00000541448 MRC2Q9UBG0 1479 aa40.48■■■■■ 4.07
ZNF664-210ENST00000541448 CFTRP13569 1480 aa40.43■■■■■ 4.06
ZNF664-210ENST00000541448 CEP164Q9UPV0 1460 aa40.39■■■■■ 4.06
ZNF664-210ENST00000541448 WDR62O43379 1518 aa40.38■■■■■ 4.06
ZNF664-210ENST00000541448 FANCD2Q9BXW9 1451 aa40.35■■■■■ 4.05
ZNF664-210ENST00000541448 PRDM2Q13029 1718 aa40.2■■■■■ 4.03
ZNF664-210ENST00000541448 CCDC88BA6NC98 1476 aa40.11■■■■■ 4.01
ZNF664-210ENST00000541448 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP39.96■■■■□ 3.99
ZNF664-210ENST00000541448 ABCC8Q09428 1581 aa39.66■■■■□ 3.94
ZNF664-210ENST00000541448 TOPBP1Q92547 1522 aa39.62■■■■□ 3.93
ZNF664-210ENST00000541448 IFT140Q96RY7 1462 aa39.58■■■■□ 3.93
ZNF664-210ENST00000541448 DNMBPQ6XZF7 1577 aa39.54■■■■□ 3.92
ZNF664-210ENST00000541448 OSCARQ8IYS5 282 aa39.45■■■■□ 3.91
ZNF664-210ENST00000541448 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP39.4■■■■□ 3.9
ZNF664-210ENST00000541448 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP39.27■■■■□ 3.88
ZNF664-210ENST00000541448 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP39.26■■■■□ 3.88
ZNF664-210ENST00000541448 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP39.22■■■■□ 3.87
ZNF664-210ENST00000541448 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP39.15■■■■□ 3.86
ZNF664-210ENST00000541448 TRIM41Q8WV44 630 aa39.15■■■■□ 3.86
ZNF664-210ENST00000541448 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP39.09■■■■□ 3.858e-7■■■■■ 30.7
ZNF664-210ENST00000541448 SOGA1O94964 1423 aa39.06■■■■□ 3.84
ZNF664-210ENST00000541448 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa39.02■■■■□ 3.84
ZNF664-210ENST00000541448 CUX1P39880 1505 aa39.02■■■■□ 3.84
ZNF664-210ENST00000541448 FGD5Q6ZNL6 1462 aa39.01■■■■□ 3.84
ZNF664-210ENST00000541448 WDR97A6NE52 1622 aa39■■■■□ 3.83
ZNF664-210ENST00000541448 CHD1O14646 1710 aa38.97■■■■□ 3.83
ZNF664-210ENST00000541448 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP38.89■■■■□ 3.82
ZNF664-210ENST00000541448 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa38.89■■■■□ 3.82
ZNF664-210ENST00000541448 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa38.89■■■■□ 3.82
ZNF664-210ENST00000541448 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa38.89■■■■□ 3.82
ZNF664-210ENST00000541448 FBLN2P98095 1184 aa38.78■■■■□ 3.8
ZNF664-210ENST00000541448 ARHGEF11O15085 1522 aa38.78■■■■□ 3.8
ZNF664-210ENST00000541448 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa38.73■■■■□ 3.79
ZNF664-210ENST00000541448 GRIN2BQ13224 1484 aa38.72■■■■□ 3.79
ZNF664-210ENST00000541448 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP38.71■■■■□ 3.79
ZNF664-210ENST00000541448 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa38.63■■■■□ 3.78
ZNF664-210ENST00000541448 PBRM1Q86U86 1689 aa38.63■■■■□ 3.77
ZNF664-210ENST00000541448 GAPVD1Q14C86 1478 aa38.61■■■■□ 3.77
ZNF664-210ENST00000541448 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP38.59■■■■□ 3.77
ZNF664-210ENST00000541448 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa38.56■■■■□ 3.76
ZNF664-210ENST00000541448 SYNJ2O15056 1496 aa38.55■■■■□ 3.76
ZNF664-210ENST00000541448 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa38.55■■■■□ 3.76
ZNF664-210ENST00000541448 TOP2BQ02880 1626 aa38.54■■■■□ 3.76
ZNF664-210ENST00000541448 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP38.54■■■■□ 3.76
ZNF664-210ENST00000541448 SYNJ1O43426 1573 aa38.53■■■■□ 3.76
ZNF664-210ENST00000541448 CLASP1Q7Z460 1538 aa38.48■■■■□ 3.75
ZNF664-210ENST00000541448 CYB5RLQ6IPT4 315 aa38.45■■■■□ 3.75
ZNF664-210ENST00000541448 ARAP1Q96P48 1450 aa38.39■■■■□ 3.74
ZNF664-210ENST00000541448 ADAMTS12P58397 1594 aa38.23■■■■□ 3.71
ZNF664-210ENST00000541448 GRIN2AQ12879 1464 aa38.2■■■■□ 3.71
ZNF664-210ENST00000541448 ERICH3Q5RHP9 1530 aa38.18■■■■□ 3.7
ZNF664-210ENST00000541448 FHAD1B1AJZ9 1412 aa38.14■■■■□ 3.7
ZNF664-210ENST00000541448 NUP160Q12769 1436 aa38.06■■■■□ 3.68
ZNF664-210ENST00000541448 CEP170Q5SW79 1584 aa38.03■■■■□ 3.68
ZNF664-210ENST00000541448 TRHP20396 242 aaPredicted RBP37.93■■■■□ 3.66
ZNF664-210ENST00000541448 SHROOM2Q13796 1616 aa37.9■■■■□ 3.66
ZNF664-210ENST00000541448 ERCC6L2Q5T890 1561 aa37.83■■■■□ 3.65
ZNF664-210ENST00000541448 KIF27Q86VH2 1401 aa37.79■■■■□ 3.64
ZNF664-210ENST00000541448 CUL7Q14999 1698 aa37.72■■■■□ 3.63
ZNF664-210ENST00000541448 IGF1RP08069 1367 aa37.69■■■■□ 3.62
ZNF664-210ENST00000541448 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa37.67■■■■□ 3.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms