RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542493.5

ZNF664-211, Transcript of zinc finger protein 664, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF664, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF664-211ENST00000542493 NISCHQ9Y2I1 1504 aa49.67■■■■■ 5.54
ZNF664-211ENST00000542493 ABCC9O60706 1549 aa45.3■■■■■ 4.84
ZNF664-211ENST00000542493 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa44.94■■■■■ 4.79
ZNF664-211ENST00000542493 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa43.03■■■■■ 4.48
ZNF664-211ENST00000542493 DNAJC5BQ9UF47 199 aa42.91■■■■■ 4.46
ZNF664-211ENST00000542493 NACADO15069 1562 aa42.61■■■■■ 4.41
ZNF664-211ENST00000542493 DCAF8L2P0C7V8 631 aa42.02■■■■■ 4.32
ZNF664-211ENST00000542493 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP42■■■■■ 4.31
ZNF664-211ENST00000542493 UNC13AQ9UPW8 1703 aa41.95■■■■■ 4.31
ZNF664-211ENST00000542493 MYO15BQ96JP2 1530 aa41.9■■■■■ 4.3
ZNF664-211ENST00000542493 BICRAQ9NZM4 1560 aa41.68■■■■■ 4.26
ZNF664-211ENST00000542493 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa41.31■■■■■ 4.2
ZNF664-211ENST00000542493 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa41.11■■■■■ 4.17
ZNF664-211ENST00000542493 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP41.05■■■■■ 4.16
ZNF664-211ENST00000542493 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa40.96■■■■■ 4.15
ZNF664-211ENST00000542493 CECR2Q9BXF3 1484 aa40.95■■■■■ 4.15
ZNF664-211ENST00000542493 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP40.75■■■■■ 4.11
ZNF664-211ENST00000542493 SCRIBQ14160 1630 aa40.73■■■■■ 4.11
ZNF664-211ENST00000542493 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40■■■■□ 3.99
ZNF664-211ENST00000542493 CUX2O14529 1486 aa39.45■■■■□ 3.91
ZNF664-211ENST00000542493 NCAPD3P42695 1498 aa39.3■■■■□ 3.88
ZNF664-211ENST00000542493 ERCC6Q03468 1493 aa39.24■■■■□ 3.87
ZNF664-211ENST00000542493 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa39.05■■■■□ 3.84
ZNF664-211ENST00000542493 SMARCA2P51531 1590 aa39■■■■□ 3.83
ZNF664-211ENST00000542493 HMGXB3Q12766 1538 aa38.99■■■■□ 3.83
ZNF664-211ENST00000542493 SMARCA4P51532 1647 aa38.87■■■■□ 3.81
ZNF664-211ENST00000542493 NESP48681 1621 aa38.71■■■■□ 3.79
ZNF664-211ENST00000542493 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP38.66■■■■□ 3.78
ZNF664-211ENST00000542493 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP38.65■■■■□ 3.78
ZNF664-211ENST00000542493 PEG3Q9GZU2 1588 aa38.58■■■■□ 3.77
ZNF664-211ENST00000542493 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP38.55■■■■□ 3.76
ZNF664-211ENST00000542493 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa38.55■■■■□ 3.76
ZNF664-211ENST00000542493 PDS5BQ9NTI5 1447 aa38.34■■■■□ 3.73
ZNF664-211ENST00000542493 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa38.27■■■■□ 3.72
ZNF664-211ENST00000542493 MROH2BQ7Z745 1585 aa38.18■■■■□ 3.7
ZNF664-211ENST00000542493 CADPSQ9ULU8 1353 aa38.06■■■■□ 3.68
ZNF664-211ENST00000542493 MRC2Q9UBG0 1479 aa37.99■■■■□ 3.67
ZNF664-211ENST00000542493 WDR62O43379 1518 aa37.93■■■■□ 3.66
ZNF664-211ENST00000542493 TRIM41Q8WV44 630 aa37.89■■■■□ 3.66
ZNF664-211ENST00000542493 CEP164Q9UPV0 1460 aa37.73■■■■□ 3.63
ZNF664-211ENST00000542493 WIZO95785 1651 aa37.69■■■■□ 3.62
ZNF664-211ENST00000542493 FANCD2Q9BXW9 1451 aa37.59■■■■□ 3.61
ZNF664-211ENST00000542493 CFTRP13569 1480 aa37.51■■■■□ 3.59
ZNF664-211ENST00000542493 OSCARQ8IYS5 282 aa37.48■■■■□ 3.59
ZNF664-211ENST00000542493 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP37.28■■■■□ 3.56
ZNF664-211ENST00000542493 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP37.27■■■■□ 3.56
ZNF664-211ENST00000542493 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP37.2■■■■□ 3.55
ZNF664-211ENST00000542493 PRDM2Q13029 1718 aa37.14■■■■□ 3.54
ZNF664-211ENST00000542493 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
ZNF664-211ENST00000542493 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
ZNF664-211ENST00000542493 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa37.03■■■■□ 3.52
ZNF664-211ENST00000542493 IFT140Q96RY7 1462 aa37.01■■■■□ 3.52
ZNF664-211ENST00000542493 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP36.88■■■■□ 3.49
ZNF664-211ENST00000542493 ARHGEF11O15085 1522 aa36.86■■■■□ 3.49
ZNF664-211ENST00000542493 ABCC8Q09428 1581 aa36.84■■■■□ 3.49
ZNF664-211ENST00000542493 TOPBP1Q92547 1522 aa36.82■■■■□ 3.48
ZNF664-211ENST00000542493 CCDC88BA6NC98 1476 aa36.79■■■■□ 3.48
ZNF664-211ENST00000542493 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP36.74■■■■□ 3.47
ZNF664-211ENST00000542493 DNMBPQ6XZF7 1577 aa36.68■■■■□ 3.46
ZNF664-211ENST00000542493 CYB5RLQ6IPT4 315 aa36.56■■■■□ 3.44
ZNF664-211ENST00000542493 CHD1O14646 1710 aa36.54■■■■□ 3.44
ZNF664-211ENST00000542493 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP36.54■■■■□ 3.44
ZNF664-211ENST00000542493 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP36.49■■■■□ 3.438e-7■■■■■ 30.7
ZNF664-211ENST00000542493 ARAP1Q96P48 1450 aa36.43■■■■□ 3.42
ZNF664-211ENST00000542493 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP36.4■■■■□ 3.42
ZNF664-211ENST00000542493 TRHP20396 242 aaPredicted RBP36.37■■■■□ 3.41
ZNF664-211ENST00000542493 FBLN2P98095 1184 aa36.35■■■■□ 3.41
ZNF664-211ENST00000542493 WDR97A6NE52 1622 aa36.3■■■■□ 3.4
ZNF664-211ENST00000542493 SOGA1O94964 1423 aa36.23■■■■□ 3.39
ZNF664-211ENST00000542493 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa36.19■■■■□ 3.38
ZNF664-211ENST00000542493 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP36.16■■■■□ 3.38
ZNF664-211ENST00000542493 CLASP1Q7Z460 1538 aa36.16■■■■□ 3.38
ZNF664-211ENST00000542493 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa36.14■■■■□ 3.38
ZNF664-211ENST00000542493 SYNJ1O43426 1573 aa36.14■■■■□ 3.38
ZNF664-211ENST00000542493 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
ZNF664-211ENST00000542493 FGD5Q6ZNL6 1462 aa36.07■■■■□ 3.37
ZNF664-211ENST00000542493 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP36.07■■■■□ 3.36
ZNF664-211ENST00000542493 GRIN2BQ13224 1484 aa36.03■■■■□ 3.36
ZNF664-211ENST00000542493 SYNJ2O15056 1496 aa35.99■■■■□ 3.35
ZNF664-211ENST00000542493 CUX1P39880 1505 aa35.93■■■■□ 3.34
ZNF664-211ENST00000542493 PBRM1Q86U86 1689 aa35.81■■■■□ 3.32
ZNF664-211ENST00000542493 GAPVD1Q14C86 1478 aa35.8■■■■□ 3.32
ZNF664-211ENST00000542493 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP35.79■■■■□ 3.32
ZNF664-211ENST00000542493 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa35.7■■■■□ 3.31
ZNF664-211ENST00000542493 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa35.68■■■■□ 3.3
ZNF664-211ENST00000542493 GRIN2AQ12879 1464 aa35.54■■■■□ 3.28
ZNF664-211ENST00000542493 NUP160Q12769 1436 aa35.45■■■■□ 3.27
ZNF664-211ENST00000542493 ADAMTS12P58397 1594 aa35.45■■■■□ 3.27
ZNF664-211ENST00000542493 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP35.44■■■■□ 3.26
ZNF664-211ENST00000542493 CEP170Q5SW79 1584 aa35.42■■■■□ 3.26
ZNF664-211ENST00000542493 ERCC6L2Q5T890 1561 aa35.42■■■■□ 3.26
ZNF664-211ENST00000542493 SHROOM2Q13796 1616 aa35.39■■■■□ 3.26
ZNF664-211ENST00000542493 FHAD1B1AJZ9 1412 aa35.34■■■■□ 3.25
ZNF664-211ENST00000542493 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa35.28■■■■□ 3.24
ZNF664-211ENST00000542493 ERICH3Q5RHP9 1530 aa35.27■■■■□ 3.24
ZNF664-211ENST00000542493 TOP2BQ02880 1626 aa35.27■■■■□ 3.24
ZNF664-211ENST00000542493 KIF13AQ9H1H9 1805 aa35.18■■■■□ 3.22
ZNF664-211ENST00000542493 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
ZNF664-211ENST00000542493 JPH4Q96JJ6 628 aa35.05■■■■□ 3.2
ZNF664-211ENST00000542493 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP35.01■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.7 ms