Protein–RNA interactions for Protein: C9JDP6

CLDN25, Putative claudin-25, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN25C9JDP6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CLDN25C9JDP6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CLDN25C9JDP6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CLDN25C9JDP6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CLDN25C9JDP6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CLDN25C9JDP6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1932.9 ms