Protein–RNA interactions for Protein: A6NEH6

TMEM247, Transmembrane protein 247, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM247A6NEH6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TMEM247A6NEH6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TMEM247A6NEH6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TMEM247A6NEH6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM247A6NEH6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 656.9 ms