Protein–RNA interactions for Protein: A1A4F0

PQLC2L, Putative uncharacterized protein PQLC2L, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PQLC2LA1A4F0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
PQLC2LA1A4F0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PQLC2LA1A4F0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PQLC2LA1A4F0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PQLC2LA1A4F0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms