Protein–RNA interactions for Protein: Q13946

PDE7A, High affinity cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 7A, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE7AQ13946 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PDE7AQ13946 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDE7AQ13946 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
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