Protein–RNA interactions for Protein: P49427

CDC34, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC34P49427 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC34P49427 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC34P49427 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC34P49427 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC34P49427 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CDC34P49427 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CDC34P49427 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
CDC34P49427 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms