Protein–RNA interactions for Protein: Q14671

PUM1, Pumilio homolog 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUM1Q14671 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.041e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.081e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 SEPT11-208ENST00000506731 659 ntTSL 56.69□□□□□ -1.341e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 SEPT11-212ENST00000512575 587 ntTSL 45.23□□□□□ -1.571e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 SEPT11-202ENST00000502401 276 ntTSL 55.04□□□□□ -1.61e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 SEPT11-215ENST00000513697 328 ntTSL 25□□□□□ -1.611e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 SEPT11-214ENST00000513373 546 ntTSL 24.78□□□□□ -1.641e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 ARL6IP4-213ENST00000536073 562 ntTSL 220.57■□□□□ 0.883e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 HSPA8-211ENST00000527983 1509 ntTSL 1 (best)10.87□□□□□ -0.674e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.73e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.423e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-237ENST00000509990 3249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.533e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-227ENST00000618441 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.72□□□□□ -0.533e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-203ENST00000502499 2664 ntTSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.073e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-201ENST00000394805 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.083e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-229ENST00000361059 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.69□□□□□ -1.183e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC7.61□□□□□ -1.193e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.343e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-230ENST00000394800 5513 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.533e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-211ENST00000505625 7306 ntTSL 1 (best)5.19□□□□□ -1.583e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.63e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 MATR3-202ENST00000502422 2250 ntTSL 1 (best)5.03□□□□□ -1.63e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 218.02■□□□□ 0.483e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.433e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.433e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)12.38□□□□□ -0.433e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-235ENST00000479802 413 ntTSL 212.38□□□□□ -0.433e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-231ENST00000472218 1109 ntTSL 210□□□□□ -0.813e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 39.94□□□□□ -0.823e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 29.51□□□□□ -0.893e-54■□□□□ 10
PUM1Q14671 SAFB2-209ENST00000591123 836 ntTSL 510.84□□□□□ -0.673e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 TPM2-205ENST00000471212 1363 ntTSL 218.04■□□□□ 0.481e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 FERMT3-205ENST00000541252 714 ntTSL 317.62■□□□□ 0.411e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 FERMT3-207ENST00000544997 1006 ntTSL 316.94■□□□□ 0.31e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.231e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.021e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 TPM2-207ENST00000604975 573 ntTSL 514.65□□□□□ -0.061e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.331e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.445e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 ATP1A1-211ENST00000537345 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.675e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 ATP1A1-203ENST00000369496 3572 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.365e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 YWHAQ-204ENST00000460093 345 ntTSL 24.54□□□□□ -1.681e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 CHMP4A-202ENST00000524955 268 ntTSL 24.5□□□□□ -1.697e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.266e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 FKBP4-201ENST00000001008 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.576e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 UBAC1-204ENST00000478485 773 ntTSL 224.32■■□□□ 1.486e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 SLC6A8-210ENST00000485324 2401 ntTSL 219.37■□□□□ 0.692e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 TOP3B-206ENST00000436282 2890 ntTSL 214.2□□□□□ -0.144e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 TOP3B-214ENST00000457270 2956 ntTSL 513.36□□□□□ -0.274e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.939e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS14-207ENST00000521466 592 ntAPPRIS P1 TSL 512.11□□□□□ -0.479e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPS14-204ENST00000518139 669 ntTSL 312.08□□□□□ -0.489e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 HNRNPR-213ENST00000641107 646 nt14.34□□□□□ -0.113e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 HNRNPR-209ENST00000476660 1637 ntTSL 1 (best)13.85□□□□□ -0.193e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 NRDC-211ENST00000491410 1020 ntTSL 220.91■□□□□ 0.941e-12■□□□□ 10
PUM1Q14671 CACTIN-205ENST00000587175 2216 ntTSL 519.59■□□□□ 0.732e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.662e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.422e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 CACTIN-204ENST00000585942 2810 ntTSL 1 (best)17.6■□□□□ 0.412e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.152e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.192e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.952e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.562e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.582e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC9.86□□□□□ -0.832e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.862e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 HMG20B-201ENST00000262949 886 ntTSL 524.74■■□□□ 1.551e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPL24-203ENST00000469605 799 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.516e-12■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPL24-201ENST00000394077 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.736e-12■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPL24-205ENST00000488288 1857 ntTSL 29.97□□□□□ -0.816e-12■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPL24-202ENST00000464595 668 ntTSL 1 (best)7.96□□□□□ -1.146e-12■□□□□ 10
PUM1Q14671 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.366e-12■□□□□ 10
PUM1Q14671 MED15-220ENST00000461076 826 ntTSL 313.47□□□□□ -0.256e-8■□□□□ 10
PUM1Q14671 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.543e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 GOLGA3-202ENST00000450791 8870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.653e-11■□□□□ 10
PUM1Q14671 TRIM44-201ENST00000299413 12964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.833e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.381e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.221e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.061e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-202ENST00000337959 3149 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.421e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 PACSIN2-212ENST00000634914 1431 ntTSL 511.57□□□□□ -0.561e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 LARP1-203ENST00000518194 450 ntTSL 511.22□□□□□ -0.611e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.162e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 SUPT16H-207ENST00000557394 2324 ntTSL 29.82□□□□□ -0.846e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.763e-12■□□□□ 10
PUM1Q14671 SMARCC1-208ENST00000492896 568 ntTSL 48.55□□□□□ -1.045e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.137e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.677e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 HDGFL2-207ENST00000615225 3100 ntTSL 517.29■□□□□ 0.367e-9■□□□□ 10
PUM1Q14671 PBX2-202ENST00000478678 1320 ntTSL 1 (best)23.28■■□□□ 1.321e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 LASP1-209ENST00000585841 1408 ntTSL 218.18■□□□□ 0.52e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.253e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.241e-6■□□□□ 10
PUM1Q14671 LASP1-205ENST00000443937 1482 ntTSL 1 (best)16.17■□□□□ 0.182e-7■□□□□ 10
PUM1Q14671 ARHGAP6-208ENST00000495242 5303 ntTSL 1 (best)15.83■□□□□ 0.123e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 ARHGAP6-206ENST00000489330 6299 ntTSL 214.63□□□□□ -0.073e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.153e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 ARHGAP6-203ENST00000380717 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)12.77□□□□□ -0.363e-10■□□□□ 10
PUM1Q14671 BRD4-210ENST00000601941 604 ntTSL 511.53□□□□□ -0.563e-10■□□□□ 10
Retrieved 100 of 12,080 protein–RNA pairs in 111.5 ms