Protein–RNA interactions for Protein: Q04741

EMX1, Homeobox protein EMX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMX1Q04741 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
EMX1Q04741 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms