Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PSMA1P25786 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms