Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
LINC00208Q96KT6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms