Protein–RNA interactions for Protein: Q6Y1H2

HACD2, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 2, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD2Q6Y1H2 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
HACD2Q6Y1H2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms