Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
C16orf54Q6UWD8 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
C16orf54Q6UWD8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms