Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUCB2P80303 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms