Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
GSK3BP49841 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
GSK3BP49841 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms