Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SNX8Q9Y5X2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms