Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0H6

KLHL4, Kelch-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL4Q9C0H6 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KLHL4Q9C0H6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KLHL4Q9C0H6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms