Protein–RNA interactions for Protein: Q8IYB8

SUPV3L1, ATP-dependent RNA helicase SUPV3L1, mitochondrial, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPV3L1Q8IYB8 COLGALT1-202ENST00000593832 2941 ntTSL 215.09■□□□□ 0.015e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 RNF44-201ENST00000274811 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 29.2
SUPV3L1Q8IYB8 PKMYT1-208ENST00000572619 495 ntTSL 414.75□□□□□ -0.055e-6■■■■■ 29.2
SUPV3L1Q8IYB8 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.155e-6■■■■■ 29.2
SUPV3L1Q8IYB8 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.175e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 29.2
SUPV3L1Q8IYB8 MAPK8IP3-213ENST00000568271 752 ntTSL 513.67□□□□□ -0.225e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 USP22-206ENST00000537526 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.255e-6■■■■■ 29.2
SUPV3L1Q8IYB8 PKMYT1-209ENST00000572658 551 ntTSL 212.02□□□□□ -0.495e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 ABCC5-201ENST00000265586 5712 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 ABCC5-202ENST00000334444 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.745e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 RBM12B-202ENST00000517700 6001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.955e-6■■■■■ 29.2
SUPV3L1Q8IYB8 ABCC5-205ENST00000427120 4697 ntTSL 1 (best) BASIC8.53□□□□□ -1.045e-6■■■■■ 29.2
SUPV3L1Q8IYB8 PFKFB4-212ENST00000478516 579 ntTSL 38.43□□□□□ -1.065e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.645e-6■■■■■ 29.2
SUPV3L1Q8IYB8 GLS-204ENST00000409428 816 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.655e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 GLS-208ENST00000457316 821 ntTSL 44.22□□□□□ -1.735e-6■■■■■ 29.2
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SUPV3L1Q8IYB8 USP3-202ENST00000380324 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.513e-6■■■■■ 29
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SUPV3L1Q8IYB8 DDX23-201ENST00000308025 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.623e-6■■■■■ 29
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SUPV3L1Q8IYB8 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.077e-8■■■■■ 28.6
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SUPV3L1Q8IYB8 SLC25A3-212ENST00000549338 1285 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 28.6
SUPV3L1Q8IYB8 SLC25A3-203ENST00000401722 6087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.647e-8■■■■■ 28.6
SUPV3L1Q8IYB8 SLC25A3-204ENST00000546766 3236 ntTSL 1 (best)10.35□□□□□ -0.757e-8■■■■■ 28.6
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SUPV3L1Q8IYB8 TAF1-215ENST00000482544 768 ntTSL 38.04□□□□□ -1.127e-8■■■■■ 28.6
SUPV3L1Q8IYB8 SLC25A3-210ENST00000548480 722 ntTSL 22.63□□□□□ -1.997e-8■■■■■ 28.6
SUPV3L1Q8IYB8 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.86□□□□□ -2.117e-8■■■■■ 28.6
SUPV3L1Q8IYB8 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.035e-6■■■■■ 28.6
SUPV3L1Q8IYB8 FAF1-205ENST00000494400 2127 ntTSL 210.67□□□□□ -0.75e-6■■■■■ 28.6
SUPV3L1Q8IYB8 FAF1-201ENST00000371778 1643 ntTSL 1 (best) BASIC9.27□□□□□ -0.935e-6■■■■■ 28.6
SUPV3L1Q8IYB8 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.228e-7■■■■■ 28.5
SUPV3L1Q8IYB8 NIPSNAP1-203ENST00000437094 674 ntTSL 311.57□□□□□ -0.568e-7■■■■■ 28.5
SUPV3L1Q8IYB8 PRRC2B-208ENST00000465931 5366 ntTSL 211.93□□□□□ -0.54e-7■■■■■ 28
SUPV3L1Q8IYB8 PRRC2B-201ENST00000320547 4950 ntTSL 211.67□□□□□ -0.544e-7■■■■■ 28
SUPV3L1Q8IYB8 PRRC2B-202ENST00000357304 11042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.584e-7■■■■■ 28
SUPV3L1Q8IYB8 PRRC2B-203ENST00000405995 9157 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.714e-7■■■■■ 28
SUPV3L1Q8IYB8 RPL3-212ENST00000467105 1396 ntTSL 1 (best)13.19□□□□□ -0.39e-7■■■■■ 28
SUPV3L1Q8IYB8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.029e-7■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.593e-7■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 29.69□□□□□ -0.863e-7■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.633e-7■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.663e-7■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD10-210ENST00000494859 705 ntTSL 527.78■■■□□ 2.044e-6■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.694e-6■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.514e-6■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD10-206ENST00000465753 997 ntTSL 1 (best)17.45■□□□□ 0.384e-6■■■■■ 27.9
SUPV3L1Q8IYB8 ANKRD10-203ENST00000460846 535 ntTSL 312.08□□□□□ -0.484e-6■■■■■ 27.9
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